Gleich am ersten Missionstag gab es für Chinas Raumfahrt eine Premiere zu feiern. Das Raumschiff „Shenzhou 6“ besteht aus einer Rückkehrkapsel und einer Orbitalkapsel. Während bei der ersten bemannten Mission „Shenzhou 5“ der Astronaut Yang Liwei in der Kapsel sitzen blieb, wechselte Fei Junlong neun Stunden nach dem Start von der Rückkehrkapsel in das Orbitmodul. Nie Haisheng verblieb unterdessen in der Rückkehrkapsel und schoss Fotos von der Orbitalkapsel mit einer Digitalkamera, nachdem er seinen Astronautenanzug ausgezogen hatte und in eine blaue Arbeitskleidung wechselte.